O mundo dos humanos mudou completamente desde quando começou a chover cartas misteriosas. A princípio essas cartas pareciam inofensivas para Dan e outras crianças do planeta. depois perceberam que essas cartas continham poderes de um outro mundo chamado Vestroia. Desde aí um grupo de garotos inventou um jogo chamado Bakugan, e então Dan e Shun, seu melhor amigo e rival e o que melhor jogava Bakugan, inventaram as regras do jogo, por um site em Joe Brown inventou para todos os que jogam Bakugan falarem de suas incríveis batalhas. Cada carta de contém um Bakugan de um atributo. São conhecidos os atributos: Atributo do Fogo (carta vermelha), Atributo da Luz (carta amarela), Atributo de Sub-terra (carta marrom), Atributo da Água (carta azul) e Atributo Darkus (carta roxa), que é o Atibuto das Trevas.Foi aberto então um portal entre o mundo dos humanos e Vestroia.Existem também os Bakugans neutros (bakugans de cor branca). Os bakugans neutros são bakugans que não pertencem a nenhum atributo, por tanto não têm poderes. 

Tudo começou quando Naga, um bakugan neutro, se sentia diferente dos outros bakugans por não pertencer a nenhum atributo. cansado de se sentir "excluído", decide se apoderar do Centro do Infinito e do Centro do Silêncio e dominar Vestroia. Naga tem uma irmã de mesmo "atributo" que ele, ela se chama Waver e teve um caso com um dos bakugans de atributo do fogo (Dragonóide, mais conhecido como Drago).

 

 

Waver, ao tentar impedir que Naga domine Vestroia, se apodera do Centro do Infinito, pois Naga conseguiu se apoderar do Centro do Silêncio e abriu um portal que levou bakugans de todos os atributos para o mundo dos humanos. O Centro do Infinito e o Centro do Silêncio ajudam a manter a paz em Vestroia e separa-o do mundo dos humanos.

 

 

Após essa união entre o mundo dos humanos e Vestroia, houve uma chuva de cartas mágicas pelo mundo inteiro. Dan, ao ver a chuva, ganhou uma carta bakugan do atributo fogo. Seu bakugan especial (bakugans que falam)é Drago. Runo, sua amiga de infância, embora ela não se lembre quem ele era, conseguiu uma carta do atributo da luz. Seu bakugan especial é Tigrera. Marucho, outro amigo de Dan, tem a carta do atributo da água. Seu bakugan especial é Preyus( Preias). Julie, admiradora de Dan, mora no Vale bakugan e tem a carta do atributo sub-terra. Seu Bakugan especial é Gowren, que fica vermelho toda vez que ela lhe elogia. Shun tem a carta do atributo ventus. Seu bekugan é Skyires. Alice tem a carta do atributo darkus. Seu bakugan é o Hidranóide ( o mesmo bakugan do mascarado). Alice tem um segredo: ela é o Mascarado. Juntos, os seis formam os guerreiros bakugans que vão um dia restaurar a paz entre os mundos.

 

 

Desde então Dan se reúne comeus amigos para derrotar o Mascarado, que vem fazendo de bons jogadores os seus lacaios, utilizando a carta da morte para retirar os bakugans dos guerreiros. Em uma das temporadas, aparece um 7° guerreiro chamado Joe brown, o mesmo que inventou o site. Tem como bakugan a Waver, irmã do Naga. Waver aparece com o Centro do Infinito dentro dela.

 

 

Os bakugans, apesar de viverem no mundo dos humanos, só conseguem sua permanência na forma de "pedras", mas no jogo eles podem voltar à sua forma normal se utilizados.

Personagens

Dan Kuso

tem 12 anos de idade, seu atributo é o Pyrus(atributo de Fogo), seu bakugan especial é o Dragonóide, mais conhecido Drago. Seu sonho é se tornar o melhor guerreiro bakugan do mundo. Seus melhores amigos são Runo e Marucho. Tem uma paixão por Runo, que também é apaixonada por ele. No último episódio aparece namorando Runo.

Runo Misaki

 

tem 12 anos, seu atributo é o Haos(atributo da luz), seu bakugan especial é Tigrera. Seus melhores amigo são Dan e Marucho. Adora jogar bakugan, mas na maioria das vezes perde. é apaixonada por Dan, mas vive implicando com ele, principalmente quando Julie fica se esfregando nele. No ultimo episodio namora Dan.

 

 

Marucho Marukuros

 

tem 11 anos de idade, seu atributo é o Arkus(atributo da água), seu bakugan especial é o Arkus Preyas, um bakugan muito palhaço e medroso por sinal. Seus melhores amigos são Dan e Runo. É apaixonado por Alice, mas ele o acha uma gracinha de menino, apesar da cara de pirralho de 9 anos.

Alice Gehabich

 

tem 14 anos de idade, é a mais velha dos guerreiros, seu atributo é o Darkus(atributo das trevas), seu bakugan especial é o Hidranóide, o mesmo bakugan utilizado pelo Mascarado. Na segunda temporada revela que ela é o Mascarado, devido a um acidente de experiência de seu avô, fazendo o mundo dos humanos e o mundo dos bakugans  se unirem.

 

 

 

Julie Makimoto

 

tem 13 anos de idade, é conhecida como fã número 1 do Dan,seu atributo é o Sub-terra, seu bakugan especial é o gohen, que sempre fica vermelho quando ela o chama de bakugan mais lindo do mundo. É apaixonada por Dan, mas muda de idéia depois que Billy, seu melhor amigo, se declara pra ela. Namora atualmente o Billy, já que Dan é apaixonado por Runo. Pode-se dizer também que ela é uma vaca em forma de gente, não por ser gorda, porque ela não é, mas por ser muito piriguete

 

 

Shun Kazami

 

tem 13 anos de idade, seu atributo é o Ventus(atributo do vento), seu bakugan especial é Skyreys. Era até aparecer o Mascarado, o melhor geurreiro bakugan de todo o mundo, o que mais jogava.  Shun esconde um segredo: a doença de sua mãe, por isso é tão silencioso e prefere ficar sozinho. Shun também é apaixonado por Alice, mas acaba ficando com a Chan, uma dos ex cobaias do Mascarado.

 

 

 

Billy Gilbert

 

tem 13 anos de idade, utiliza do mesmo atributo que Julie, é o melhor amigo dela. Vira lacaio do mascarado, porque queria se tornar o melhor guerreiro bakugan, mas depois se arrepende quando vê sua melhor amiga(Julie) prestes a ir pra dimensão da morte, logo após um brinquedo que foi dado de presente a ele, cair a bolsa de Julie. A partir daí ele percebe que ela o guarda desde pequena em sinal da amizade deles.